Obserwatorium Geofizyczne zostało wzniesione w 1915 roku, z inicjatywy polskiego fizyka Stanisława Kalinowskiego. Zespół budowlany według projektu Łukasza Wolskiego składał się wtedy z drewnianego pawilonu pomiarów absolutnych, murowanego pawilonu do aparatury rejestracyjnej, budynku biurowego z mieszkaniem woźnego oraz altany niemagnetycznej. 

Obserwatorium zostało uruchomione sześć lat później, w 1921 roku, a w 1925 w miejscu projektowanej altany niemagnetycznej stanął niewielki budynek do badań elektryczności atmosferycznej. Ten właśnie obiekt, przebudowany w latach 1927-28 z uwagi na błędy konstrukcyjne, cieszy się od niedawna statusem zabytku. 

Stacja badań elektryczności atmosferycznej, fot. Mazowiecki Wojewódzki Konserwator Zabytków

Willa Chojnatka
Niedługo po zakończeniu drugiej wojny światowej Tymczasowy Zarząd Państwowy Majątków Opuszczonych i Porzuconych wydzierżawił Willę Chojnatkę wraz z jej zabudowaniami Instytutowi Fizycznemu przy Muzeum Przemysłu i Rolnictwa. Murowana willa najprawdopodobniej powstała w latach 20. XX wieku kiedy właścicielem posesji był przemysłowiec Leon Finkelstein, który wraz z bratem zajmował się prowadzeniem składu aptecznego przy ul. Bielańskiej 5 w Warszawie. 

W 1952 roku Willa Chojnatka świeżo po remoncie została przekształcona w Stację Obsługi Liczników Elektrycznych wraz z mieszkaniami dla pracowników Obserwatorium. Dwa lata później budynek został przekazany Zakładowi Geofizyki PAN, tym samym zmieniając się w laboratorium, bibliotekę, budynek biurowy i magazyn. W 1963 roku nieruchomość przeszła na własność Skarbu Państwa w drodze zasiedzenia. 

Obecnie w budynkach swoją siedzibę ma Obserwatorium Geofizyczne im. Stanisława Kalinowskiego wchodzące w skład Instytutu Geofizyki Polskiej Akademii Nauk.